Lo primero es instalarlo en Ubuntu, directamente descargándolo de su web. Desde el repositorio no funciona.

https://dl.slic3r.org/linux/

Las rutas entonces que hay que poner en Repetier (pestaña slicer, botón Manager) sería para la configuración:

/home/USUARIO/.Slic3r

*Sustituyendo USUARIO por el usuario real

Y para el ejecutable:

/usr/bin/slic3r